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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Gado de Leite. Para informações adicionais entre em contato com cnpgl.biblioteca@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
30/11/2023 |
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Data da última atualização: |
30/11/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SANTOS, I. S.; TAVARES, C. P.; KLAFKE, G. M.; RECK, J.; MONTEIRO, C. M. O.; PRATA, M. C. de A.; GOLO. P. S.; SILVA, A. C.; COSTA-JUNIOR, L. M. |
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Afiliação: |
IGOR S. SANTOS, UNIVERSIDADE FEDERAL DO MARANHÃO; CAIO P. TAVARES, UNIVERSIDADE FEDERAL DO MARANHÃO; GUILHERME M. KLAFKE, INSTITUTO DE PESQUISAS VETERINÁRIAS DESIDÉRIO FINAMOR; JOSÉ RECK, INSTITUTO DE PESQUISAS VETERINÁRIAS DESIDÉRIO FINAMOR; CAIO M. O. MONTEIRO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE GOIÁS; MARCIA CRISTINA DE AZEVEDO PRATA, CNPGL; PATRÍCIA S. GOLO, UNIVERSIDADE FEDERAL RURAL DO RIO DE JANEIRO; ARISTOFANES C. SILVA, UNIVERSIDADE FEDERAL DO MARANHÃO; LIVIO M. COSTA-JUNIOR, UNIVERSIDADE FEDERAL DO MARANHÃO. |
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Título: |
Automatic method based on deep learning to identify and account Rhipicephalus microplus larval hatching. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
Medical and Veterinary Entomology, v. 37, p. 665-674, 2023. |
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DOI: |
http://doi.org/10.1111/mve.12664 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Reports of Rhipicephalus microplus resistant populations worldwide have increased extensively, making it difficult to control this ectoparasite. The adult immersion test, commonly used to screen for acaricide resistance, produces the results only after 40 days of the tick collection because it needs the eggs to be laid and larvae to hatch. The present study aims to develop an automatic method, based on deep learning, to predict the hatching of R. microplus larva based on egg morphology. Initially, the time course of embryonic development of tick eggs was performed to discriminate between viable and non-viable eggs. Secondly, using artificial intelligence deep learning techniques, a method was developed to classify and count the eggs. The larval hatching rate of three populations of R. microplus was evaluated for the software validation process. Groups of three and six images of eggs with 12 days of embryonic development were submitted to the software to predict the larval hatching percent automatically. The results obtained by the software were compared with the prediction results of the hatching percentage performed manually by the specialist and with the results of the hatching percentage of larvae obtained in the biological assay. The group with three images of each population submitted to the software for automatic prediction of the larval hatching percent presented mean values of 96.35% ± 3.33 (Piracanjuba population), 95.98% ± 3.5 (Desterro population) and 0.0% ± 0.0 (Barbalha population). For groups with six images, the values were 94.41% ± 3.84 (Piracanjuba population), 95.93% ± 2.36 (Desterro population) and 0.0% ± 0.0 (Barbalha population). Biological assays showed the following hatching percentage values: 98% ± 1.73 (Piracanjuba population); 96% ± 2.1 (Desterro population); and 0.14% ± 0.25 (Barbalha population). There was no statistical difference between the evaluated methods. The automatic method for predicting the hatching percentage of R. microplus larvae was validated and proved to be effective, with considerable reduction in time to obtain results. MenosReports of Rhipicephalus microplus resistant populations worldwide have increased extensively, making it difficult to control this ectoparasite. The adult immersion test, commonly used to screen for acaricide resistance, produces the results only after 40 days of the tick collection because it needs the eggs to be laid and larvae to hatch. The present study aims to develop an automatic method, based on deep learning, to predict the hatching of R. microplus larva based on egg morphology. Initially, the time course of embryonic development of tick eggs was performed to discriminate between viable and non-viable eggs. Secondly, using artificial intelligence deep learning techniques, a method was developed to classify and count the eggs. The larval hatching rate of three populations of R. microplus was evaluated for the software validation process. Groups of three and six images of eggs with 12 days of embryonic development were submitted to the software to predict the larval hatching percent automatically. The results obtained by the software were compared with the prediction results of the hatching percentage performed manually by the specialist and with the results of the hatching percentage of larvae obtained in the biological assay. The group with three images of each population submitted to the software for automatic prediction of the larval hatching percent presented mean values of 96.35% ± 3.33 (Piracanjuba population), 95.98% ± 3.5 (Desterro population) and 0.0% ± 0.0 (... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Controle; Eclosão larval; Larval hatching. |
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Thesagro: |
Carrapato; Larva; Ovo; Resistência. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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Marc: |
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650 $aLarva
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650 $aResistência
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653 $aEclosão larval
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700 1 $aCOSTA-JUNIOR, L. M.
773 $tMedical and Veterinary Entomology$gv. 37, p. 665-674, 2023.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
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Data corrente: |
26/08/2019 |
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Data da última atualização: |
06/11/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
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Autoria: |
VELLOSO, C. C. V. |
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Afiliação: |
Camila Cristina Vieira Velloso. |
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Título: |
Caracterização de cepas de Bacillus e avaliação do seu potencial de promoção de crescimento em genótipos de milho. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
2019. |
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Páginas: |
127 p. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Dissertação (Mestrado em Bioengenharia) - Universidade Federal de São João del-Rei, São João del-Rei, 2019.
Orientadora Sylvia Morais de Sousa Tinôco. |
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Conteúdo: |
Diversos fatores bióticos e abióticos contribuem para a queda da produtividade do milho no Brasil. O uso de bactérias promotoras de crescimento de plantas tem se mostrado uma alternativa eficiente e sustentável para mitigar estes problemas. O objetivo deste trabalho foi caracterizar duas cepas de Bacillus e avaliar o seu potencial de promoção de crescimento em genótipos de milho. O sequenciamento do genoma das duas cepas de Bacillus (B116 e B119) da Coleção de Microrganismos Multifuncionais da Embrapa Milho e Sorgo usando Illumina HiSeq 4000 e a estratégia 150-paired end seguido da análise parcial do genoma mostrou a presença de genes envolvidos nos mecanismos de formação de endósporos, quimiotaxia, motilidade, competição na rizosfera e mecanismos de promoção de crescimento vegetal. Ambas as cepas de Bacillus produziram exopolissacarídeos (EPS) e fixaram nitrogênio. A cepa B119 de B. megaterium produziu maiores quantidades de AIA e sideróforos, ao passo que a cepa B116 de B. thuringiensis foi caracterizada como melhor formadora de biofilme, produziu mais fosfatases e solubilizou mais fosfato de cálcio. A cepa B116 atingiu a máxima produção de fosfatases em 48 h, enquanto a B119 precisou de 96 h para atingir o mesmo ponto de produção. Além disso, as plântulas de milho inoculadas com ambas as cepas e induzidas ao estresse hídrico tiveram uma maior redução da área superficial de raízes finas e aumento das raízes mais grossas, o que resultou em maior peso seco de raiz. Esse remodelamento radicular levou a uma menor perda do peso seco total quando comparado ao controle não inoculado, indicando sua capacidade de reduzir os danos causados pela seca. Vinte e um genótipos de milho foram inoculados com as duas cepas e cultivados em hidroponia. Dez dias após a inoculação, diferentes características de raiz e peso seco foram avaliadas nas plântulas de milho. A inoculação com as cepas de Bacillus aumentaram o peso seco e o sistema radicular de 16 dos 21 genótipos testados, sendo que não houve resposta significativa para um genótipo e quatro responderam negativamente, confirmando a interação genótipo-dependente entre plantas e bactérias. As características de promoção de crescimento avaliadas in vitro e os resultados dos cultivos em hidroponia corroboraram a presença dos genes que compõem as diferentes vias metabólicas e demonstraram que a associação com essas bactérias pode beneficiar as plantas como resultado da modulação de raízes, aquisição de nutrientes e maior tolerância a estresses. As informações obtidas permitiram a caracterização genômica dos mecanismos de promoção de crescimento, maximizando o entendimento da interação planta-bactéria, que possibilitam o uso dessas cepas como inoculantes microbianos para aumentar a produtividade do milho em campo. MenosDiversos fatores bióticos e abióticos contribuem para a queda da produtividade do milho no Brasil. O uso de bactérias promotoras de crescimento de plantas tem se mostrado uma alternativa eficiente e sustentável para mitigar estes problemas. O objetivo deste trabalho foi caracterizar duas cepas de Bacillus e avaliar o seu potencial de promoção de crescimento em genótipos de milho. O sequenciamento do genoma das duas cepas de Bacillus (B116 e B119) da Coleção de Microrganismos Multifuncionais da Embrapa Milho e Sorgo usando Illumina HiSeq 4000 e a estratégia 150-paired end seguido da análise parcial do genoma mostrou a presença de genes envolvidos nos mecanismos de formação de endósporos, quimiotaxia, motilidade, competição na rizosfera e mecanismos de promoção de crescimento vegetal. Ambas as cepas de Bacillus produziram exopolissacarídeos (EPS) e fixaram nitrogênio. A cepa B119 de B. megaterium produziu maiores quantidades de AIA e sideróforos, ao passo que a cepa B116 de B. thuringiensis foi caracterizada como melhor formadora de biofilme, produziu mais fosfatases e solubilizou mais fosfato de cálcio. A cepa B116 atingiu a máxima produção de fosfatases em 48 h, enquanto a B119 precisou de 96 h para atingir o mesmo ponto de produção. Além disso, as plântulas de milho inoculadas com ambas as cepas e induzidas ao estresse hídrico tiveram uma maior redução da área superficial de raízes finas e aumento das raízes mais grossas, o que resultou em maior peso seco de raiz. Esse remo... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Estresse Hídrico; Hidroponia. |
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Thesagro: |
Bactéria; Genoma; Sistema Radicular; Zea Mays. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/201289/1/Sylvia-dissertacao-Camila.pdf
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Marc: |
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300 $a127 p.
500 $aDissertação (Mestrado em Bioengenharia) - Universidade Federal de São João del-Rei, São João del-Rei, 2019. Orientadora Sylvia Morais de Sousa Tinôco.
520 $aDiversos fatores bióticos e abióticos contribuem para a queda da produtividade do milho no Brasil. O uso de bactérias promotoras de crescimento de plantas tem se mostrado uma alternativa eficiente e sustentável para mitigar estes problemas. O objetivo deste trabalho foi caracterizar duas cepas de Bacillus e avaliar o seu potencial de promoção de crescimento em genótipos de milho. O sequenciamento do genoma das duas cepas de Bacillus (B116 e B119) da Coleção de Microrganismos Multifuncionais da Embrapa Milho e Sorgo usando Illumina HiSeq 4000 e a estratégia 150-paired end seguido da análise parcial do genoma mostrou a presença de genes envolvidos nos mecanismos de formação de endósporos, quimiotaxia, motilidade, competição na rizosfera e mecanismos de promoção de crescimento vegetal. Ambas as cepas de Bacillus produziram exopolissacarídeos (EPS) e fixaram nitrogênio. A cepa B119 de B. megaterium produziu maiores quantidades de AIA e sideróforos, ao passo que a cepa B116 de B. thuringiensis foi caracterizada como melhor formadora de biofilme, produziu mais fosfatases e solubilizou mais fosfato de cálcio. A cepa B116 atingiu a máxima produção de fosfatases em 48 h, enquanto a B119 precisou de 96 h para atingir o mesmo ponto de produção. Além disso, as plântulas de milho inoculadas com ambas as cepas e induzidas ao estresse hídrico tiveram uma maior redução da área superficial de raízes finas e aumento das raízes mais grossas, o que resultou em maior peso seco de raiz. Esse remodelamento radicular levou a uma menor perda do peso seco total quando comparado ao controle não inoculado, indicando sua capacidade de reduzir os danos causados pela seca. Vinte e um genótipos de milho foram inoculados com as duas cepas e cultivados em hidroponia. Dez dias após a inoculação, diferentes características de raiz e peso seco foram avaliadas nas plântulas de milho. A inoculação com as cepas de Bacillus aumentaram o peso seco e o sistema radicular de 16 dos 21 genótipos testados, sendo que não houve resposta significativa para um genótipo e quatro responderam negativamente, confirmando a interação genótipo-dependente entre plantas e bactérias. As características de promoção de crescimento avaliadas in vitro e os resultados dos cultivos em hidroponia corroboraram a presença dos genes que compõem as diferentes vias metabólicas e demonstraram que a associação com essas bactérias pode beneficiar as plantas como resultado da modulação de raízes, aquisição de nutrientes e maior tolerância a estresses. As informações obtidas permitiram a caracterização genômica dos mecanismos de promoção de crescimento, maximizando o entendimento da interação planta-bactéria, que possibilitam o uso dessas cepas como inoculantes microbianos para aumentar a produtividade do milho em campo.
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Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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